附睾囊肿多见于附睾头部，可能是平时频繁过度手淫，睾丸附睾慢性炎症感染等原因引起，大多数无临床症状，也可以表现为睾丸坠胀。如果囊肿较小，无明显疼痛等不适，一般不需要治疗，但如果囊肿较大，伴有肿胀疼痛等不适，而且是已婚生育，可以进行手术治疗，由于手术后会损伤附睾管而影响生育，未婚未育一般不建议手术治疗。
附睾囊肿需要手术，附睾囊肿由于局部炎症粘连使附睾管阻塞，其中微小单一的附睾输精管阻塞后管腔液潴留，形成囊肿，附睾囊肿会引起精子质量、精子活力和精子数量急剧下降，引发男性不育症，是会影响怀孕的。
如果附睾囊肿较小，且病人无明显临床症状，则需要行定期复查，如果没有明显增大趋势，可不必做相应处理。如果附睾囊肿较大，且病人常有阴囊坠胀不适、疼痛等感觉，影响病人的正常生活，则可以行附睾囊肿切除手术的治疗。
附睾囊肿，没有明显症状的，是不需治疗，而症状较重或囊肿体积较大，并且已婚有子女者，可进行手术摘除，但是手术有会破坏附睾管因而影响生育，未婚的病人需要慎重。不要吃一些上火的食物。
出现囊肿一般治疗可以采取手术治疗，药物不能治疗，出现疼痛注意是否有炎症发生，可以到医院外科就诊做一下血常规、彩超等检查，根据病情选择治疗方法。注意休息，不要吃辛辣食物。