卵巢囊肿的危害还是挺大的，其中之一就是可以导致不孕，影响生育。一旦卵巢囊肿变大或者变性，就有可能使精子、卵子或者受精卵不能正常运行，从而影响生育，导致不孕的恶果。最严重的是发生癌变，威胁生命。卵巢囊肿增大极易发生感染、扭曲、出血或爆裂，只要积极治疗，这种疾病就不算严重。如果治疗不及时，可引起不孕不育症。
输卵管有囊肿，要看囊肿的大小有没有影响到输卵管排卵。如果囊肿比较小可以定期复查，观察囊肿是否有变化。如果囊肿生长的速度比较快，或者囊肿比较大，超过了5cm，就需要进行手术切除治疗。给带来生命的威胁。有些瘤性的囊中甚至会发生癌变。
输卵管囊肿是妇科疾病中的一种，如果输卵管急性期炎症没得到及时有效的治疗，就形成了输卵管积脓。严重的可造成女性不孕，如果治疗不及时，诱发其病情恶化，就容易导致女性的不孕。输卵管囊肿会对生育造成很大的影响。
怀孕后检查输卵管，囊肿一般不需要进行处理，这时候注意检查是否有宫外孕，平时尽量注意保胎，治疗避免有早产或者流产的现象，这时候尽量注意控制病情，平时多注意卫生，多休息为主，可以在检查后根据指导进行治疗，平时注意适当的锻炼。
有输卵管积水和巧克力囊肿，首先输卵管积水可以阻碍精子和卵子的结合，造成不孕，需要在腹腔镜下做输卵管疏通术，同时做巧克力囊肿挖出，保留卵巢就可以，这两个手术是可以同时进行的。
