肺癌消融手术的缺点是经皮穿刺肿瘤时稍有偏差，就会导致穿刺失败或病灶消融不全，当肿瘤位置较深时，很可能会损伤邻近大血管、支气管等。所以采取哪种治疗方式，还是要结合个人病情。
射频消融是治疗实质性肿瘤的一种微创技术。肺癌患者可以通过这种方式治疗疾病，不仅能较好的缓解病症，术后并发症也比较少。但对于非小细胞肺癌或肺转移癌的患者，射频消融术并不是首选方法。此术缺点是经皮穿刺肿瘤时稍有偏差，就会导致穿刺失败或病灶消融不全，当肿瘤位置较深时，很可能会损伤邻近大血管、支气管等。
肺癌介入治疗优点是创伤小一点，病人比较容易耐受，痛苦也是比较小的，这个就是做介入治疗一个非常大的优势，肺癌介入治疗的缺点是介入治疗费用比较高，介入治疗可能要多次去做，像一个射频消融不可能一次性就把肿块全部就治掉了，或者气管内的切除，可能也要几次把它切除下来，后面可能切除之后再放支架，步骤会相对比较多。
做消融的时候疼痛比较明显，也会低烧、乏力、全身不适、恶心、呕吐等，一持续3-5天，少部分人可以持续到1-2周，消融以后出现咳嗽，出现一些其他并发症，比方气胸、胸腔积液、出血、感染等。
从有效率上来说，单药免疫治疗肺癌有效率还不高，它的有效率一般只有百分之二十到百分之三十，这个有效率比较低。另外一个重要的缺点，是它的毒副作用。尽管免疫治疗的副反应非常小，但是毕竟还有一部分人会出现严重副反应，这些严重副反应表现多种多样，它可以表现为间质性肺炎，也可以表现为胃肠炎，还可以表现为肝炎、肾炎，甚至出现甲状腺功能减退，也非常常见。