轻微肛周脓肿可以理疗、外敷中药或用抗生素作局部注射等，还可以采用热水坐浴进行治疗，平时保持肛门清洁，注意卧床休息，多喝水保持大便通畅，注意饮食，多吃润肠通便的食物。
小孩肛周脓肿建议及时就诊，通过抗感染进行治疗。
小孩的肛周脓肿如果发病时间比较短，还没有形成明确的脓腔，这种情况下一定要积极的就诊，通过抗感染治疗，因为小孩一般不使用药物治疗，所以建议静脉输注抗生素，或肛周脓肿表面涂抹抗生素。如果小孩的肛周脓肿已经明确形成脓腔，建议积极的手术治疗。一般可以做肛周脓肿切开引流术。
肛周脓肿是因直肠炎症等蔓延到周围形成是一个浓腔，脓液较少时可以通过大剂量的消炎药治疗，但脓液较多时应该要切开引流，并且要大剂量，长时间用消炎药治疗（一般7-10天）。肛周脓肿如果不及时处理，浓腔破溃后就发展形成肛瘘，肛瘘治疗就相对复杂了，所以建议在医生的指导下消炎治疗，如果浓液太多没法控制，要尽快切开引流。
肛周脓肿是因直肠炎症等蔓延到周围形成是一个浓腔，脓液较少时可以通过大剂量的消炎药治疗，但脓液较多时应该要切开引流，并且要大剂量，长时间用消炎药治疗（一般7-10天）。肛周脓肿如果不及时处理，浓腔破溃后就发展形成肛瘘，肛瘘治疗就相对复杂了，所以建议在医生的指导下消炎治疗，如果浓液太多没法控制，要尽快切开引流。
肛周脓肿的治疗方式主要是进行药物治疗。新生儿出现肛周脓肿是需要尽快进行治疗的，否则肛周脓肿严重是会导致肛门周围发生感染炎症，进而导致出现痔疮直肠癌的可能。一定要定期到医院进行复查，以免发生感染。