全身治疗：可根据病情口服、肌内注射或静脉滴注抗生素。饮食调理：食物应以少渣、低脂、易消化、无刺激性为宜，少食含粗纤维食物、产气食物和生冷瓜果。要给予高蛋白、高热量、富含维生素的饮食。
直肠炎可以灌肠疗法结合口服消炎药，远离诱发因素，避免吃辛辣的食物。平时多注意饮食调理，少吃辛辣，刺激性食物，多注意腹部保暖，防止着凉，生活饮食规律，这样可以加快病情的恢复。
中药是较为安全合适的，可以去除病源，调理肠道，中药“理气舒肠方”等中药。饮食少量多次地饲喂轻易消化的牛奶、蔬菜和肉汤、粥等。此外，作为消化整肠剂，内服由淀粉、脂酶、乳酶生和胃蛋白酶等成分等量混合。
肠炎疾病的治疗要“三分治七分养”。吃药是一种辅助治疗。吃些清热解毒药物、调节菌群失调药物、固涩药物。不要吃生冷食物，不能熬夜，多休息，精神不要太紧张，免疫力增强后肠炎就会慢慢好转。重症肠炎可以灌肠，对于粪便硬块嵌顿引起的直肠炎，应采取灌肠，解除粪便压迫。
饮食要清淡，不可有辣椒，酒等刺激性东西。不可吸烟。建议吃高纤维食物，以促进排便和大便形成，减少油脂食物摄入。如多吃青菜，芹菜，藕等。不要吃猪肉等大油的东西，主食建议以粗粮为主，如玉米，饭豆，红薯等，少吃大米白面，不太有助于大便形成。