使用广谱的抗生素进行抗炎治疗。局部进行温水坐浴，也可以用药物坐浴，然后配合局部的理疗。肛瘘伴急性感染出现的疼痛，没有特殊有效的办法，可以适当吃止痛的药物。
可以能服用消炎药和止痛药，外用一些药膏涂抹，不行就去打吊瓶消炎，这些方法只能暂时缓解症状，但还是尽快手术治疗。可以选择微创无痛手术的，痛苦小，一般不用住院的。恢复也较快。
对于肛瘘病人，如果有急性感染，可以给予抗炎药物。同时，排便后应注意保持肛门清洁。肛瘘病人应该及时手术，因为这种疾病无法治疗。建议病人去医院治疗，明确具体诊断，保持排便通畅，以免加重病情。
平时将心情保持乐观平常心，不要焦虑上火；要规律的饮食，不要过度饮酒。当然治疗是关键，及时涂抹专业有效的，在选择产品上面，必须要选择好点的可靠的。平时不要吃辛辣刺激的食物，饮食以清淡易消化为主，还要预防便秘的发生，可以多吃一些富含粗纤维的食品。
肛瘘常有肛周脓肿自行溃破或切开排脓的病史，此后伤口经久不愈，成为肛瘘外口，主要症状是反复自外口流出少量脓液，污染内裤，有时脓液刺激肛周皮肤，有瘙痒感，若外口暂时封闭，脓液积存，局部呈红肿，则有胀痛，封闭的外口可再穿破，或在附近穿破形成另一新外口，如此反复发作，可形成多个外口，相互沟通，如瘘管引流通畅，则局部无疼痛，仅有轻微发胀不适。
肛瘘手术大多采用的都是拔线手术，手术后要定期的绷紧线。然后尽现真的特别的疼，如果疼痛难忍可以吃止疼药。手术以后要勤换药，注意观察伤口，要保持大便通畅，定时排便，保持肛周清洁卫生，勤换内裤，增加体育锻炼，避免久坐久站，可以做一些提肛运动。