出现肛周囊肿主要与各种因素引起肛腺感染有关，比如痔疮、肛瘘、肛门周围皮肤毛囊汗腺炎及肛门周围皮肤病等感染。除此之外，与医源性因素、术后因素等引起肛周皮肤损伤感染所致。
常见的原因是肛周脂肪组织比较多，比较松软，肠道细菌通过肛窦进入到肛周间隙而形成感染。有时外阴部护理不当，也可能会造成肛周囊肿。如果是轻度的肛周脓肿，局部表现为发红，可能摸着会有硬块。
如果已经形成脓肿了应该及时切开引流及换药治疗，继而疼痛加剧、红肿发热、坠胀不适、坐卧不宁、夜不能眠、大便秘结、排尿不畅成里急后重等直肠刺激症状，有肛周脓肿要积极抗感染治疗，给以手术引流脓肿，保证大便通畅，注意个人卫生。
肛周囊肿形成的常见原因是肛裂、大便干燥或用力排便等引起肛管直肠内微小损伤，肠道内细菌可经过损伤处的肛腺浸入到肛管直肠周围间隙而形成感染，进而形成脓肿。如果脓肿的位置较深，则可能有发热、乏力等全身症状，肛周部的疼痛红肿往往不太明显。肛管直肠周围脓肿一般不能自行痊愈，如任其发展，最终脓肿将向肛周皮肤或肛管直肠腔内破溃形成肛瘘。应该多吃水果蔬菜维生素含量高的食物。
肛周脓肿是肛门直肠周围感染性疾病，主要原因是肛窦感染，炎症顺着括约肌间隙扩散，组织坏死形成脓肿。这类感染发作之前大都有两个突出因素，一是腹泻，导致肛管水肿，肛窦充血糜烂，炎症从该处形成，深入；另一因素是饮食过多的辛辣饮食（饮酒）等，更易招致肛周脓肿形成。全身因素，比如恶性肿瘤病人、免疫力低下病人、糖尿病病人，机体细菌大量繁殖，形成肛周脓肿。