肛周脓肿一旦形成应立即进行抗感染治疗，并注意卧床休息，减少活动。饮食宜清淡易消化，忌食刺激性食物。局部可熏洗、坐浴或热敷，如果保守治疗不缓解或者病情较重者需要手术治疗。
肛周脓肿破后会有脓液流出，首先要挤出脓液，用温盐水和高锰酸钾溶液坐浴，用生理盐水清洗伤口，碘伏消毒，注意个人卫生。其次要用抗生素抗感染，或者选择手术引流，达到治愈的目的。
肛周脓肿是一种常见的肛肠疾病，但是在肛周脓肿初期，很多人以为只是一种疖子，所以并没有特别重视。随着病情的加重，加上内裤对脓肿的摩擦，因痒挠脓肿等。可能导致肛周脓肿溃烂。这个时候要注意及时治疗。
肛周脓肿如果溃破了应及时就医。经医师检查，如果脓肿部位表浅，经一般清创处理，定时局部换药及适当应用抗生素治疗就可以。如果脓肿部位较深或有多个脓腔则需要进一步扩创使脓液得到充分引流，以防新的脓肿形成及其他并发症如肛瘘等情况。
要及时的去医院接受正规的手术治疗，不要自己乱买药物给小孩服用，要听从医生的嘱咐去治疗。注意营养合理，食物尽量做到多样化，多吃高蛋白、多维生素、低动物脂肪、易消化的食物及新鲜水果、蔬菜，不吃陈旧变质或刺激性的东西，主食粗细粮搭配，以保证营养平衡。
肛周脓肿手术后、不要急着运动，要等伤口愈合后才可以进行运动，要适当的运动，增强抵抗力，肛周脓肿手术后，可以在床边自己走走，不然剧烈的运动会使伤口开裂的、病人会出现疼痛，一系列的症状的出现，手术后要注意休息等愈合后就可以适当的运动了。肛周脓肿术后提肛运动可以存进肛门部位的肌肉收缩促进血液循环，对愈合有好处，但是不用一直做。
肛周脓肿可以一次性进行医治术，一次性医治术通常第一步先对肛周脓肿进行引流，第二步需要寻找肛周脓肿的内口，连同内口一起解决，这样可以达到肛周脓肿的一次性医治。但是，不是所有的肛周脓肿都可以一次性医治，有些病人的肛周脓肿可能需要分次进行手术。