有低位单纯性肛瘘、低位复杂性肛瘘、高位单纯性肛瘘、高位复杂性肛瘘、直肠前庭瘘等，就认识下低位单纯性肛瘘、低位复杂性肛瘘，这常见的两种，单纯性肛瘘这，简单的说，是只有一个瘘管的，并这种疾病情况，是通过外括约肛深部以下，内口在肛窦的。
肛瘘的分类法甚为复杂，目前国内外各学者都按自己对肛肠解剖的认识及临床经验提出不同的分类法，这对临床记录与统计带来了一定的困难。为此，作者根据肛肠解剖，结合近20年的临床记录并参考了国内外的分类，提出了新的分类法，并应用此法统计1，154例的临床资料，阐明肛瘘手术中发现瘘管的位置、形态、病变性质以及肛瘘术。
肛瘘分为外瘘和内瘘。肛瘘是指肛管直肠与肛门四周皮肤相通的肉芽肿性管道，民间又称为“偷粪老鼠”，由内口、瘘管、外口三部分组成。内口位于齿线四周；外口位于肛周皮肤上，以30岁-40岁中年人为主，多见于青壮年男性。临床症状有流脓血性、粘液性分泌物，肛门潮湿、肛门瘙痒，肛门湿疹，间歇性反复发作，不能自愈。
瘙痒：肛门部皮肤由于脓液及其他排出物刺激，常感觉皮肤瘙痒。疼痛：若外口封闭，瘘管存积脓液，或粪便进入瘘管，则会疼痛加重或排粪时疼痛加重，而内盲瘘则常感直肠下部和肛门部灼热不适，排粪时疼痛加重。硬结或瘢痕：由于瘘管壁及瘘口的反复刺激，使纤维组织增生，在管壁和瘘口形成质韧的结缔组织，常表现为瘘管周围皮肤变色，表皮脱落，凹陷变形，触及条索状硬结通向肛门内。
疼痛瘘管通畅无炎症时，无疼痛，只有肛门局部略有肿胀感，行走时可加重，若外口封闭，瘘管存积脓液，或粪便进入瘘管，则会疼痛加重或排粪时疼痛加重。排脓排脓是轻度肛瘘症状的主要症状。