浅表性肛瘘是可以做微创的。但是肛瘘的微创手术并不是所有类型的肛瘘都适用，即使是微创手术，也是有针对性的。如果是复杂性肛瘘，做微创手术后的复发率也会随着瘘管的增多随之提高。所以没有真正意义上肛瘘的微创手术。
微创无痛的肛瘘治疗方法是通过直肠纤维镜进入到肛门里面，通过监视器，直接对内口进行微创电凝，使肛瘘的内口干结闭合，然后洗干净瘘管里面的脓液，这样以后大便后，粪便里面的细菌和粪水进不到四面的组织里面去，就不会形成感染，疼痛。肛瘘一般可以采取挂线或者是手术治疗，需要采取积极的预防，不要有思想负担，多保重粗纤维食物保持大便通畅。积极的预防，提高身体素质。
肛瘘如果是比较轻微的肛痿程度，利用微创手术之后是可以将内口的位置顺利进行关闭，而在关闭之后就可以达到治疗的效果性，而如果是比较重的肛痿程度，微创手术未必就能够完全性关闭，甚至是关闭之后还会容易复发，所以想要选择微创手术，也是要看肛痿的程度性。
肛瘘门诊手术，保守用药无效。肛瘘分低位，高位，是否复杂，多个窦道等，术后部分有一定的复发机率，低位的，单一的肛瘘，可以治疗，术后随便换药，都不会复发，复发机率高的多见于复杂性瘘管，不是直线，是曲线或折线的窦道，或多个病理性窦道。或高位，创面大，术后换药引流不彻底，易复发。
肛瘘手术后一般复发可能性低，复杂性肛瘘术后复发可能性增高，注意饮食清淡规律避免便秘，忌辛辣刺激食物以及发物，注意肛门清洁卫生，术后应用消炎药物治疗避免感染，定期复查肛检。