低位肛瘘又分为低位单纯性肛瘘和低位复杂性肛瘘。高位肛瘘分为高位单纯性肛瘘和高位复杂性肛瘘。单纯性肛瘘就是一根瘘管，复杂性肛瘘就是有两根或两根以上的瘘管。
辨别肛瘘：肛周有外口，常有脓性分泌物或粪汁流出，时觉瘙痒。初期表现为脓肿症状，又以全身症状为主，即标实为主，当辨热的偏盛，后期则重在局部，特别是复杂性及结核性肛瘘，因病久者多以正虚为主。须辨阳虚阴虚之各异。
肛瘘由于分泌物的刺激，使肛门部潮湿，瘙痒，有时形成湿疹。当外口愈合，瘿管中有脓肿形成时，可感到明显疼痛，同时可伴有发热，寒颤，乏力等全身感染症状。肛瘘的治疗原则是手术为主，只有进行手术，才能找到原发的内口，并把感染的肛窦、肛门腺及其导管切除干净。
四种。肛管括约肌间型、经肛管括约肌型、肛管括约肌上型、肛管括约肌外型。肛管括约肌上型，为高位肛瘘，较为少见，瘘管在括约肌间向上延伸，越过耻骨直肠肌，向下经坐骨直肠间隙穿透肛周皮肤。
按瘘管与括约肌的关系分为肛管括约肌间型、经肛管括约肌型、肛管括约肌上型、肛管括约肌外型。肛管括约肌外型，瘘管自会阴部皮肤向上经坐骨直肠间隙和肛提肌，然后穿入盆腔或直肠。