肠镜的做法分为无痛肠镜和普通肠镜，这两种做法有轻微的差别，也有相同的地方。其中普通肠镜的做法，需要在行肠镜检查的前一天，口服泻药，清洁肠道，使在行肠镜检查前肠道已经排空，然后在行肠镜检查前使用局部麻醉药物，后润滑肠道，将肠镜从肛门进入消化系统小肠末端，然后往外慢慢退镜，查看有无肠道疾病。
肠镜检查是诊断胃肠道疾病的一种常用检查方法，检查者要脱去下身衣服，大多采取膀胱截石位或者是膝胸位，医生把肠镜从肛门插入肠道进行检查。平时注意生活和饮食习惯，不食辛辣刺激，不熬夜，不喝酒等。
做肠镜主要排除肛门、直肠以及结肠的各种病变，检查前医生会让服用泻药以及食用好消化的食物，需要禁食水，现在多采取麻醉下检查以减少病人的痛苦，检查时有一个十分柔软的器械从肛门口进入肠道检查。
做肠镜主要排除肛门、直肠以及结肠的各种病变，检查前医生会让服用泻药以及食用好消化的食物，需要禁食水，现在多采取麻醉下检查以减少病人的痛苦，检查时有一个十分柔软的器械从肛门口进入肠道检查。
胶囊镜主要作用是观察肠道内壁粘膜是否有溃疡，出血，息肉、炎症等疾病。大小和胶囊差不多，从口腔进入，沿着消化道到胃，到十二指肠再到腹部肠腔，24小时之内会从肛门排出，做胶囊镜也是需要空腹的。检查期间避免剧烈运动及进入强磁场区域，以防图像信号受到干扰。