肛瘘不做手术很难自行愈合，保守治疗往往不能凑效。如果害怕做大的手术，可以给予挂线疗法。如果肛瘘长期得不到去根的治疗，慢性炎症的不断刺激，具有一定的恶变倾向。临床很多老年性肛门癌有肛瘘病史，常见有鳞癌和粘液腺癌，恶性程度均较高。
不做手术，肛瘘可能会有流脓和渗液的现象，可能会发生反复的感染或者出现疼痛等局部症状。
如果有肛瘘，但是不做手术的话，这种情况因为局部炎症的反复有可能会导致肛周脓肿或者是有大便失禁的可能性，肛瘘不做手术由于其炎症长期刺激肛周，有可能会由普通的低位单纯性肛瘘而变成复杂的高位肛瘘，同时，部分肛瘘的患者由于其长期不治而有可能会出现癌变的可能。
建议到正规医院的肛肠科进行检查，及早在医生的指导下治疗，万不可拖延病情。平时注意不要吃辛辣刺激性的食物，会加重病情。
肛瘘不做手术会有流脓和流水的现象，可能会发生反复的感染或者出现疼痛等局部症状。肛瘘是一种慢性炎症性疾病，如果长期得不到医治，在慢性炎症的不断刺激，会出现恶变倾向。
肛瘘的症状是会有肛周经常的流脓流水，并有瘙痒或疼痛，反复发作，经久不愈等症状，治疗是要手术治疗的，也可以找中医外科大夫上药捻进行治疗，注意休息，应到正规医院检查和治疗。
肛瘘可以治好，对于肛瘘治疗的原则就是采取手术方法进行治疗。单纯性肛瘘未见症状反复发作，肛瘘处于静止期，可以暂时观察。对于肛瘘反复肿痛、流脓、反复发作，因为肿痛、流脓反复发作可以刺激局部组织增生，反复增生容易造成局部组织恶变的可能性，所以及早采取手术的治疗方法，彻底解决。