肛瘘的人都有自己切身的体会与痛苦。一旦肛瘘形成，自愈的机会极少，瘘管复杂化后，带来许多麻烦与一定的危害性。首先是脓水污染内裤，剧烈活动后可促使脓液外溢，局部经常受到刺激，皮肤摩擦、瘙痒，非常痛苦，影响工作和学习，久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，出现贫血、发作亦越加频繁，形成互为因果。
肛瘘危害有：肛瘘长期流脓流水，污染内衣，造成病菌滋生，可诱发肛门湿疹、肛门瘙痒等其他肛肠疾病是肛瘘的危害性。另外还有肛门失禁的危害。还会给工作和生活带来很多的不便。
肛瘘的危害包括：肛门周围分泌脓水，脓水污染内裤，易引起皮炎湿疹；肛瘘形成后在肛门周围形成肿块，长时间引起疼痛；由于多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而形成多发性、复杂性肛瘘。
按照肛瘘的常规手术原则，即从内口到外口沿瘘管全部切开，将肛瘘开放，那么肛门内外括约肌、肛提肌将大部分被切断，但将会引起不同程度的肛门失禁，平时多注意些，及时上厕所，及时到医院治病。
时间太早伤口恢复不好，术后一定要注意肛门周围的清洁干燥卫生，勤换洗，平时多吃些新鲜的蔬菜和水果，尤其是香蕉，尽量保持大便通畅，少吃油腻性的食物，忌食辛辣的刺激性的食物。
高位肛瘘有患者的身体变得较为虚弱和消瘦等危害、使得患者自身机体精神较为不振，与此同时其抗病的能力在临床上也相应的会出现有所下降，患者此时可能会出现有贫血的情况，并且由于贫血症状的发作，使得患者的肛瘘疾病在临床上发病越加频繁，终形成互为因果。