通常来说，普通肠镜检查会有一定的痛苦感。
肠镜是一支细长可弯曲的医学仪器，直径大约1厘米，结肠镜通过肛门进入直肠，直到大肠，可让医生观察到结肠和大肠的内部情况。结肠镜检查是医生用来检查大肠及结肠内部病变的一种诊断方式。而普通肠镜检查一般不会进行全麻，所以会有一定的痛苦感。建议术前做好清洁工作，以免加重不适的症状。
普通肠镜检查肠子比较直的不太痛，肠子弯的过弯的时候特别疼，是那种无法忍受的痛，不过时间很短，撑过去就没事了，注意一定要放松，不要因为紧张绷得太紧，那样肠镜很难通过。
肠镜检查一般无明显不适。对肠镜前需要完善肠道准备，检查前3天尽量少渣饮食，食用米粥，面条等好消化的食物，检查前1天开始应用果导片导泻，检查当天不要吃饭，也不要喝水，一边喝一边适当活动，有助于肠道的蠕动，促进大便的排出。
相对来说是比较痛苦的，但可通过打麻药缓解。
结肠镜检查，是目前临床上常见的检查结肠和直肠的检查方法。在发现结肠炎、直肠炎、结肠息肉和直肠息肉、结肠癌和直肠癌方面，发挥着重要的作用，准确率高，误诊率低。但是做肠镜是比较痛苦的，九成左右的患者都还会有痛苦感。结肠镜检查时，需向肠道内注入气体，患者胀痛明显，检查完后仍有疼痛。
做完肠镜要注意三天内不要做剧烈运动，一般情况下需要禁食三天，如过腹胀过于明显，应立刻告知医生或护士，医生会根据状况做出作相应的处理，出院后根据医嘱进食。
无痛肠镜检查一般是不痛苦的。具体情况分析如下：
无痛肠镜主要是用丙泊酚做全身麻醉的，病人在麻醉后是没有意识的，但是在做结肠镜的时候，需要注入适当的气体，观察肠腔的情况，为了观察病变，可能会反复的进镜观察，有时会导致肠腔内有大量气体，醒来后会出现肚子绞痛，顺时针揉肚子排出气体就可以了。总体来说，无痛肠镜是一个不错的选择。
通常情况下，患者做十二指肠镜检查，不会痛苦。具体情况分析如下：
十二指肠镜检查是一种利用纤维内镜检查十二指肠疾病的方法，常用于诊断胰胆管开口处的病变,如结石、狭窄、肿瘤等，目前患者可以通过静脉复合麻醉注射丙泊酚等，让患者检查时无任何不适，因此患者做十二指肠镜检查，不会痛苦。
患者配合治疗的同时，还应注意休养，避免劳累，注意保暖，多喝热水，多食用清淡的高蛋白食物，以促进身体的恢复。