肛瘘是很难自愈的，必须接受手术治疗。肛瘘多由肛门直肠周围脓肿破溃后形成，虽然外口有时会出现暂时的愈合，但瘘管和内口依然存在，很容易复发。只有通过手术根除外口、瘘管、内口，才有可能治疗好。
临床工作中多见于机体，肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。到医院肛肠科检查明确病情及时治疗处理。注意个人卫生清洁，合理饮食清淡，易消化吸收为主食物，加强营养增加抵抗力，及时给予手术处理修复治疗。按时复查，避免错过治疗时期。
肛门瘘管简称肛瘘，是肛管直肠与肛门周围皮肤相通的感染性管道，其内口位于齿线附近，外口位于肛门周围皮肤上，长年不愈。大部分肛瘘由肛门直肠脓肿破溃或切开排脓后形成。脓肿逐渐缩小，但肠内容物仍不断进入脓腔，在愈合缩小的过程中，常形成迂曲的腔道，引流不畅不易愈合，日久后腔道周围有许多疤痕组织，形成慢性感染性管道。
建议尽早到医院肛肠外科治疗。日常生活中，清淡饮食，忌辛辣刺激油腻性食物，多吃蔬菜、水果等富含维生素类的食物。保持大便的通畅，不要抽烟喝酒，注意休息。肛门瘘管一般是需要手术来治疗的。是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，主要是导致排便时疼痛等，只能通过手术来解决。
肛周湿疹和肛瘘的致病原因是不一样的。肛周湿疹病因复杂，常为内外因相互作用结果。常见的引起肛周湿疹的原因有慢性消化系统疾病、精神紧张、失眠、过度疲劳等内因以及生活环境、气候变化、食物等因素。而肛瘘是由于直肠肛管周围脓肿引起的。它一般都是由于化脓性感染所引起的。
引起肛门瘘管的原因比较多，可能是因为反复肛裂进而导致病菌感染就形成了肛门瘘管，也有可能是直肠肛门损伤或者先有肛门脓肿，久不治疗就导致得了肛门瘘管。采用药物和手术相结合的方法来治疗。