如果是单纯性肛瘘，瘘管较直，手术较为简单，直接将瘘管切开即可，手术时间约5-10分钟。如果瘘管弯曲，内口较多，为复杂性肛瘘，多需沿内口切除肛瘘，沿肛瘘管道寻至内口，手术较为复杂。
肛瘘手术大概需要一个月的时间能恢复好，具体的要看手术损伤的程度以及恢复过程中是否发生感染。肛瘘手术中的高位复杂性的肛瘘在恢复时间上就比较长，肛瘘手术后首先要保证大便顺畅，不论是干结还是腹泻都会影响恢复，便后注意清洗坐浴，再消毒换药。
肛瘘手术，如果是单纯性肛瘘，瘘管较直，手术较为简单，直接将瘘管切开即可，手术时间约5-10分钟。如果瘘管弯曲，内口较多，为复杂性肛瘘，多需沿内口切除肛瘘，沿肛瘘管道寻至内口，手术较为复杂。
根据个人体质不同给予合适的检查和治疗方案，应该需要手术治疗，每个人的病情不同，手术方式不同，所需要的费用也不同，医保农合都可以报销，不要有太大的心理负担，积极配合医生治疗。
肛瘘的主要原因是肛周脓肿，直肠肛门损伤，肛门裂反复感染等因素引起的治疗的时间和严重程度有关一般在一周到半个月左右的不等，术前需要准确定位瘘管的位置和内口的位置，才能为手术的成功提供最有力的保障。
肛瘘手术后，如果没有继发细菌感染，正常生理功能可在半个月至一个月左右完全恢复。手术后，应多吃苹果、香蕉、绿豆牙、冬瓜、黄瓜、苦瓜、芹菜、菠菜、韭菜等粗纤维食品，以促进胃肠蠕动，保持排便通畅。