肛门指检主要用于检查患者直肠下段，肛门至肠道内距离小于6-7cm的部分疾病。低位的直肠癌、肛管癌、良性肿物、直肠下段息肉、较大的痔核均可通过肛门指检发现。同时对肛瘘内口检查时需采取肛门指检。
肛门指检是肛肠科常用的、最基本的检查方法，肛管和直肠下端的疾病都可以通过直肠指检来做初步的诊治。比如直肠下端的肿瘤、直肠癌以及低位直肠癌等，都可以通过直肠指检来进行诊断。另外，肛乳头瘤甚至痔疮也可以通过直肠指检来诊断。
大部分的直肠癌的发病位置比较低，多发于直肠下端部位，而指检可以触摸到距肛周7-8cm深的部位，一般能够轻易发现内部高低不平的硬块，抽出手指的时候还能看到粘液和暗红色的血液。但是很多在早期会误以为是痔疮，或者惧怕肛门指检而放弃了这项检查，也因此错过了早发现的机会，直肠癌若不及时治疗，也会危害生命。所以要正确对待肛门指检，它可以有效的查出直肠癌。
肛门指检在100元-500元，肛门镜检查在200-300元，肛门指检是先做肛周局部按摩，然后将食指进入直肠仔细检查，明确直肠内是否有肿块结节，退出后观察指套上是否有血染。
这不会影响检验结果。当做肛门指检的专家做肛门指检时，说体位摆的不够好，也就是说这样的身体姿势对检查不太方便，检查的视野会稍微差一点，但只专家生当时仔细而顺利地检查，结果应该没问题。
