结肠息肉目前治疗以肠镜下切除为主，具有创伤小、恢复快的作用，巨大型息肉肠镜下的治疗也可以根治性切除，中医主要在于对病因的治疗，目的是降低内镜下切除手术后息肉的复发的几率。根据不同的证型可以采用不同的药物，如湿热下注的患者用黄连解毒汤加减，脾虚气滞的患者用良附丸加减，寒凝结滞的患者用金匮肾气丸，这些方法有助于减少术后息肉的复发，但是这类方法并不能直接让息肉就彻底消失，总体来说是以内镜下治疗为主。
酌情采用内镜下微创治疗、手术治疗，切除部分做病理化验。治疗中如果有出血，要止血治疗。预防能做的是在饮食习惯、生活习惯上做一些改变。有研究表明，多吃粗纤维的食物，少吃肉类可能会降低肠息肉、肠癌等结肠疾病的发生率。
中医治疗结肠息肉的方则就是调理气机，经络和淤血的淤积为主，中医治疗方法也包括了针灸和一些比较简单的保健推拿，所以一定要去中医院进行相关的治疗，还要仔细地照顾好生活方面的饮食和结构习惯。
对于息肉可采取经肠镜电灼，切除后进行病理检查，对于直径超过1.5cm以上的广基息肉，距肛门口不超过7~8cm，可以在麻醉下手术切除，根据病理检查结果决定是否进一步处理，如果息肉位置较高，不能经肛门局部手术或经肠镜解决，需要经腹切除手术。
结肠息肉需要手术治疗，并且没有办法通过局部药物治疗完全消除。此外，手术后，人们应该注意冷、硬、辣和刺激的饮食。如果炎症发生，需要及时和定期的系统治疗。不可能通过输液完全。只能起到一定的抗炎作用。因此，操作是必需的。