治疗小关节紊乱的办法主要是保守治疗。假如没有效果可以使用药物进行小关节注射，这样可以减少小关节的疼痛。这种药物注射到小关节周围能很好地消除炎症，治疗疼痛不适。
手法治疗：手法可解滑膜嵌顿，使关节位置恢复正常。有缓解痉挛、解除疼痛的。患者取俯卧位，医者立于其患侧，在腰部疼痛点旁施行滚法，使痉挛的肌肉得以松弛，时间约10分钟。
一般都是使用保守治疗的。如果出现麻木的状况可以进行下一步的治疗选择，就是手术治疗。这类微创的治疗措施，是很好的能帮助消除导致小关节紊乱的各种不利的因素，恢复小关节周围正常的状态。
颈椎小关节紊乱的检查有体格检查、颈椎正侧位X光片等多种，建议及时治疗。
体格检查可以接触到颈椎病灶的位置，脊椎的脊椎位置和脊椎中心的位置。颈椎的屈伸和转动运动都会受到很大的限制。第二，颈椎正侧位X光片，能发现颈椎的微小脱臼，并能显著地改善关节的配对。建议患者及时去医院检查，积极治疗疾病，加强锻炼注意控制体重。
理疗：急性期可用电兴奋刺激以使肌肉松弛，其余超短波、微波治疗应在恢复期或慢性疼痛时使用。小关节囊封闭：急性期可止痛解痉，慢性期可镇痛消炎，对本病的康复很有利。