肯定是有一点痛感的，毕竟是需要刺穿皮肉，疼痛在可承受范围之内，所以不必过多担心，及时到医院外科就诊，进行针对性的检查，明确诊断后对症治疗，在做淋巴结穿刺活检手术可以进行局部麻醉的。但在注射麻药的过程中会痛，所以不用过于担心疼痛。
婴儿做腰穿会使用麻药的，穿刺时有一定的疼痛，但是完全是可以忍受的，不会很痛，一般不会出现后遗症，如果怀疑有颅内感染等疾病，可以做一下检查，再选择治疗，因为腰椎穿刺脑脊液可以明确的反映颅内是否有感染以及颅内压力的情况，对于病情的判断和治疗有非常明显的意义。
大多数人只有在穿刺时才会感觉到轻微的疼痛，就像针刺一样。羊水穿刺是由专业医生操作的侵入性检查。为了达到更好的穿刺效果，医生会在穿刺前对孕妇进行超声波定位，并在超声波监测下选择最合适的部位进行穿刺，以避免对胎儿造成伤害的可能性很小。
一般情况下，脑膜炎患者做穿刺时有一定的疼痛感。
脑膜炎穿刺指行腰椎穿刺术，需在病人腰椎第3-4或第4-5椎间隙入针穿刺蛛网膜下腔，测脑脊液压力并保留脑脊液标准化验。通常穿刺前会用利多卡因进行局部麻醉，因此病人通常仅有打麻药的痛感，类似于通常皮试的痛感。穿刺时，可出现轻度胀痛感，如果医生操作不但，伤及神经根时，可出现放电样痛，但疼痛程度不重。
巧克力囊肿实际上是子宫内膜异位症的一种，如果囊肿不大，疼痛不明显，可以不要用药治疗，如果囊肿较大，或在疼痛明显可以采取囊肿穿刺抽液或者是直接手术治疗，囊肿穿刺一般用于未婚的，或者是已婚有生育要求的，囊肿中等大小的，可以在B超引导下穿刺，疼痛有一点，但可以忍受。
