药物治疗，在急性骨髓炎早期，局部已经出现红肿热痛，要积极给予抗生素类的药进行输液，局部可以用药物外敷消肿止疼，配合中药，清热解毒，消肿止疼的药物内服和外用；开窗引流术，X线检查显示骨质局部已有破坏及骨髓腔阴影增宽者，可在骨髓腔内积脓部位进行骨皮质钻孔或开窗，防止炎症扩散，以利分泌物引流。
骨髓炎通过以下方法治疗最好：
对于骨髓炎的治疗首先要清除病灶，做到既不损伤正常的组织，又要准确保护骨与组织的完整性，给患者带来最小的伤害而获得最大的利益。之后行反复的冲洗，伤口内部使用抗生素控制炎症，使敏感药物直接作用在病灶处，全面彻底清除细菌。再次将较近的正常组织或者是松质骨充填缺损处，通过加压、牵拉，使骨获得再生重建，并且最后可给予中药的调护，提高患者的全身免疫力和抵抗力以加快骨髓炎的恢复。
骨髓炎在治疗上关键在于早期诊断，早期控制感染，防止死骨形成，避免转为慢性骨髓炎。早期需要联合应用大剂量有效抗生素，通常在体温恢复正常后，仍继续使用两周左右。抗生素治疗2-3天，不能控制局部感染时，应手术治疗。局部制动固定，缓解疼痛。慢性化脓性骨髓炎以手术治疗为主，原则上是清除死骨，炎性肉芽组织和消灭死腔。
在治疗上关键在于早期诊断，早期控制感染，防止死骨形成，避免转为慢性骨髓炎。早期需要联合应用大剂量有效抗生素，通常在体温恢复正常后，仍继续使用两周左右。抗生素治疗2-3天，不能控制局部症状时，应即刻手术治疗。局部制动固定，缓解疼痛。慢性化脓性骨髓炎以手术治疗为主，原则上是清除死骨，炎性肉芽组织和消灭死腔。
骨髓炎的治疗方法有药物治疗和手术治疗。药物治疗如左氧氟沙星等。手术治疗又可分为穿刺吸引术、开窗引流术、带蒂肌肉瓣充填术以及截肢术。如果是骨髓炎的急性发作，可以使用一些抗生素来治疗，局部关节疼痛时可以使用止痛消炎的药物。骨髓炎的病人如果有严重的脓肿，可以住院进行局部切开引流，主要是钻孔引流术和开窗减压，术后还要进行患肢功能锻炼，在康复初期要注意控制运动强度，以免发生骨折。