乙肝肝区隐痛的原因很复杂，可能乙肝所导致，可能是胃炎，十二指肠球部炎症所导致，可能胆囊炎的症状，可能是肋间神经痛的症状，到医院检查肝胆B超，胸片，肝功能，乙肝两对半，胃镜，根据检查结果对症治疗。
乙肝大三阳肝区疼痛主要原因是肝脏病变引起的，肝细胞的坏死和脂肪变形，肝脏的充血、渗出、肿胀等造成肝脏表面的包膜被撑紧，包膜上分布有感觉神经，此时乙肝大三阳会产生疼痛的感觉。肝区疼痛往往是乙肝大三阳病情恶化的征兆，此时千万不要掉以轻心。但有时候乙肝大三阳肝区疼痛也可能有别的原因，肝脏和胆囊是相连的，也就是说当胆道出现病变，诸如胆囊炎、胆结石等，肝脏也会出现疼痛的感觉。
乙肝病人可以同时合并有胃肠道方面的疾病。乙肝是比较常见的传染性的疾病，主要来自于母婴垂直传播，感染率是非常高的，会出现上腹部的不适，甚至会出现上腹部的疼痛等症状，需要通过肝功能等指标来明确。
乙肝腹胀腹痛的原因是因为肝细胞受到损害而导致胆汁分泌减少，消化脂肪和蛋白质的能力下降，食物聚集在回肠下端和升结肠，在细菌的作用下，肠道内食糜发酵，产生大量的气体，引起腹胀，腹痛。
乙肝小三阳患者肝区隐痛，或是肝脏受损发出的信号，不少人参加过重体力劳动后出现肝区疼痛症状，经过休息以后有所减轻，应该及时到正规的肝病专科医院进行全面的检查，并按照检查的结果进行针对性的治疗，切不可得过且过，耽误了治疗的最佳时期，造成严重的后果。
首先是劳累过度，劳累时，体内能量供给不足，即可出现肝区疼痛或肝区不适，其次是肋间神经痛：有人常可感觉肝区或肋间的刺痛或跳痛，这不是肝区痛，是肋间神经痛;再次肝炎及肝炎恢复期和肝病后的肝区不适心理障碍综合征，也可能引起肝区疼。