低位复杂肛瘘疾病容易复发，所以要注意坐时要让肛门处于悬空状态，便后用水清洗肛部，可以在医院买个电动肛门护理包，里面有肛部清洁器帮助便后清洗，肛部药浴盆放在马桶上熏蒸坐浴，坐姿时用肛部支撑垫帮助悬空伤口，促进水肿消退。
肛瘘手术不复杂，是肛肠外科常见的手术之一，手术时间一般在50分钟左右（如果就一个瘘）还可能是挂线手术后平躺3个小时左右，麻药过了之后就比较疼，手术后头一次大便可以用些泻药，这样会不痛苦，多喝水，另外还要按时换药。
复杂肛瘘手术的成功率大约在50%左右。有2-3个内口或者更多内口，外口也可能有两到三个。外口和内口约多，手术也就越低复杂，成功率也随之下降。复杂肛瘘手术的成功率大约在50%左右。
低位复杂肛瘘手术在手术过程中，需要提前进行麻醉处理，基本上不会感觉到任何的痛苦，但是在手术之前需要配合医生进行肠镜检查，这时候会感觉到一些痛苦，手术之后前三天基本上是最难受的时候，必要的时候可以口服一些止痛的药物，随后症状就会慢慢改善的。
复杂性肛瘘在肛肠科中是属于大手术的，由于脓液不断刺激肛周皮肤，常感觉瘙痒，肛周潮湿不适，皮肤变色、表皮脱落，纤维组织增生和增厚，有时形成湿疹。肿痛：一般不疼，当脓液积存于管腔内引流不畅时，局部胀痛，当脓液流出后疼痛马上减轻。