长期吃恩替卡韦是有副作用的，会出现头痛、疲惫、眩晕、呼吸困难、腹部疼痛、恶心、四肢水肿、身体虚弱、失眠、消化道不良、胃肠道副反应，会出现恶心呕吐，腹痛腹泻等症状，还会导致病人失眠，注意适量服用。
此药可以长期服用，此药是一种核苷类的抗病毒药物，主要是用于治疗慢性乙型病毒性肝炎还有乙型病毒性肝炎引起来的肝硬化。乙型肝炎或者乙型肝炎引起的肝硬化达到抗病毒的标准。
如果原本就表面抗原很低，长期的口服恩替卡韦进行抗病毒治疗，转阴的可能性就大一些。如果原本就是大三阳的基础上，恩替卡韦可能要吃很多年，那么短期是不可能转阴的。
乙肝吃恩替卡韦是可以从中获益的，需乙肝病人规范化、合理使用恩替卡韦治疗，不轻易不随意停药和换药，恩替卡韦是治疗乙肝的首选药物，大约有10%的病人可以治好，有80%的病人可以长期控制乙肝病毒，乙肝病毒控制住能降低肝癌的发生率，这种获益对病人是很值得。乙肝病人要及时、合理、规范的用药物治疗。
吃恩替卡韦喝酒会影响药物的疗效，也许会对身体造成伤害，密切观察身体情况，一旦出现不适及时就医。这种药物治疗乙型肝炎病毒的，服用后不能喝酒，而本身有疾病也不适合喝酒。
恩替卡韦是慢性乙型肝炎抗病毒治疗中重要的药物之一，主要用于病毒复制活跃、血清转氨酶持续升高或肝脏组织学提示有活动性病变的乙型肝炎患者。其副作用主要常见于ALT升高、疲劳、眩晕、腹部不适、上腹痛、恶心、肝区不适、肌痛、失眠和风疹等，这些不良反应多为轻到中度。