甲状腺囊肿治疗主要依据甲状腺囊肿的肿物多少、大小来决定。较小甲状腺囊肿无需治疗，较大甲状腺囊肿或者短期内迅速增大的甲状腺囊肿。由于甲状腺囊肿多数是良性，手术切除之后，一般无需再进行其它方面的治疗。但是如果甲状腺囊肿较多，甲状腺组织也进行了部分切除，可能造成一部分病人甲状腺功能减低，术后还需配合进行甲状腺激素的治疗。
诊断甲状腺囊肿，检查甲状腺素的水平。如果甲状腺素增高，说明有可能是恶性的肿瘤。如甲状腺素不高等，则无需处理，勤查一查即可。甲状腺囊肿是一种良性疾病，在一般情况下不会引起症状，但是一旦发生，就要注意及时治疗，否则会造成严重后果。如甲状腺素的变化，论证问题比较严重，手术切除治疗势在必行。饮食上注意清淡、多油少盐。
此外，甲状腺囊肿的病人应保持平时的心理状态，乐观和愉快的心态，缓解种种压力。培养良好饮食习惯，食用新鲜水果及海产品。
甲状腺囊肿的治疗方法如下：
1、小甲状腺囊肿无需治疗。
2、较大甲状腺囊肿或短期快速增大的甲状腺囊肿，如出现相应压迫症状，需介入手术。
3、甲状腺囊肿多为良性，切除手术后无需其他治疗。患者如有甲状腺功能减退，术后还应配合甲状腺激素的治疗。
4、囊肿属于良性病变，对身体没有很大的影响，可以不做治疗或用中药调理，一般也没有什么特效药，有必要时可以考虑手术切除。
结节性甲状腺囊肿治疗方法如下：
1、饮食治疗：对于体积较小、甲状腺功能未出现异常的囊肿，可以先行观察。患者饮食中可多吃海带、紫菜、海鱼、高碘盐等含碘食物。
2、服药治疗：患者囊肿引起甲状腺功能异常，一般需服药控制。目前主要有两种放射碘和激素类药物的方案。
3、手术治疗：体积较大且服药治疗无效的甲状腺囊肿，或可能发生恶性病变的甲状腺囊肿，可选择仅切除囊肿、部分甲状腺组织切除、全甲状腺切除3种方案。
对于甲状腺囊肿，良性的几率较大，具体还需要通过甲状腺彩超来进一步判断，如果甲状腺的囊肿较小，而且甲状腺的功能也是正常的，可以定期彩超随访观察，也无需进行治疗，甲状腺的囊肿超过3厘米，或者出现了压迫的症状，或者不排除甲状腺癌变，还应当及时的手术处理治疗。
可以手术治疗。甲状腺囊肿都是由于外伤感染炎症，甲状腺肿腺瘤，结节性甲状腺肿，发生退行性改变所导致。大多数甲状腺囊肿都是属于良性病变，如果囊肿体积较小，可以定期复查甲状腺彩超。如果囊肿体积比较大，一般超过三公分，平时注意饮食，休息避免，辛辣刺激性食物，进步活动时要注意，避免甲状腺囊肿破裂引起继发性囊内出血。