超声波碎石的副作用是会出现血尿，肾功能损害，还会有石街形成，较大结石碎开后碎石会堵塞输尿管，称为石街形成，会导致腰痛等症状。另外碎石后或许还会出现感染。平时要注意护理。
因为大量的超声波聚集，除了碎掉结石，对输尿管上皮以及肾盂黏膜都有一定的损伤。做体外超声波碎石是一种微创手术，在体表没有明显的伤口，通过大量的超声波聚集可以碎掉泌尿系统的结石。
体外超声碎石治疗没什么副作用的。只是有失败的，不是百分之百成功。结石病是一种常见病，多发病，包括胆囊结石，肝内胆管结石，胆总管结石，肾结石，输尿管结石，膀胱结石，尿道结石。
肾结石在超声波碎石情况下会比较疼痛，但大多数可以忍受，结石在碎石后一周左右内可以排出。需要配合多饮水，勤排尿，多吃蔬菜、水果，多做剧烈运动，如跑步、跳绳、爬楼梯等。
如果是做肾结石的手术，至于价格问题，每家医院的费用都是不同的，应该去医院咨询，一般是2千元-3千元，肾结石一定要注意多喝水，多排尿，多运动，患者平时在日常生活当中还要注意饮食调理。不要吃草酸盐过高的食物。
肾结石超声波碎石指征的危害是会造成周围组织的损伤，血尿，感染。严重的会造成大出血，或者是重度感染，感染性休克。体外冲击波碎石有可能需要多次碎石。病程治愈比较长，碎石后会造成周围组织的粘连，造成下一步处理的难度。