益生菌吃了不会有副作用，吃益生菌主要是有调理胃肠道的作用，根据医生考虑，没有关系，严重，应该及时地去医院的消化内科就诊，近期少吃一些生冷的食物。要注意平时的饮食清淡。
菌群失调是导致吃益生菌拉肚子的主要原因，可以遵循医嘱口服乳酸菌素片、双歧杆菌四联活菌片等药物来平衡肠道菌群。注意补充水分，以防电解质紊乱，出现脱水症状。可以少量服用益生菌，益生菌能够促进肠道菌群的消化，排出肠道内的毒素和垃圾。多吃膳食纤维，促进肠胃蠕动，有利于消化吸收，每餐七分饱，吃饭要细嚼慢咽养成良好的饮食习惯。
益生菌没有什么副作用，但是如果说益生菌有副作用，那就是不能长期的，过量的服用，因为很容易产生依赖症。益生菌字面的意思就是有益于健康的细菌。能够平衡肠道菌群，促进肠道的蠕动，同时可以预防改善腹泻和便秘的症状。对于有害菌的抑制效果也非常好，同时能刺激肠道免疫机能，增强免疫力。
益生菌的副作用有免疫缺陷的患者服用后益生菌会变成病菌。对于益生菌过敏的人服用后会产生过敏反应。肠道菌群失调严重的病人服用后会出现短期的腹痛腹泻状况。但益生菌对80%的人服用后都没有什么副作用，还会促进肠道的加速蠕动。
吃了益生菌便秘可能是以下原因引起的。
由于肠道菌群紊乱导致的消化不良、腹泻、便秘等症状，益生菌具有调整肠道菌群的功效。吃了益生菌出现严重的便秘症状，主要是因为个人的身体素质和肠胃的问题，比如大便干结、排便不顺畅、腹胀、腹痛等，可以通过腹部的热敷，推拿等方式来治疗。平时要多做运动，避免抽烟、饮酒，多饮水。