豆浆含有一些抗营养因子，不仅不利于营养物质的消化和吸收，而且对健康有害。豆类含有抑制剂、皂苷和凝集素。对付它们的最好方法是煮豆浆。长期食用豆浆的不应该忘记补充微量元素锌。豆类中含有一定量的低聚糖，这会引起嗝气、肠鸣音、腹胀等症状，所以胃溃疡的少吃点。胃炎和肾衰竭需要低蛋白饮食，而豆类及其产品富含蛋白质，其代谢产物会增加肾脏负担，应禁食。
长期喝豆浆可能会引起胃肠胀气。
每天摄取约两杯200ml的豆浆的话，大概会代替身体十分之一左右的自身分泌的雌激素，从而会刺激内膜、乳腺出现增生的情况，尤其是患有乳腺增生、子宫肌瘤的女性。因为豆浆是由大豆制成，而大豆里面含的嘌呤成分很高，且属于寒性食物，会出现乏力、体虚、精神疲倦等症状。
建议：豆浆一定不要与抗生素一起服用，因为二者会发生化学反应。急性胃炎和慢性浅表性胃炎者不宜食用豆制品，以免刺激胃酸分泌过多加重病情。
豆浆含有丰富的蛋白质、磷脂、铁、钙等，有利于身体健康，但是并不适合所有的孩子喝。两岁以内的孩子胃肠功能发育不成熟，豆浆内含有一些不溶性的纤维素，喝豆浆容易造成宝宝腹胀、打嗝、消化不良，甚至腹泻。
男人长期喝豆浆可能会引起胃部不适。
如急性胃炎和慢性胃炎患者不宜食用豆制品，否则会刺激胃酸分泌过多加重病情，或者引起胃肠胀气，胃溃疡者也最好少吃。结石病和痛风病患者也不宜喝豆浆，豆类中的草酸盐可与肾中的钙结合，易形成结石，会加重肾结石的症状。而且黄豆中富含亲水的嘌呤，嘌呤是引起痛风的根源，所以痛风病人亦不宜喝豆浆。
建议适量饮用，胃部不适者不饮用。一定要喝新鲜豆浆，放置时间过长后饮用，容易导致腹泻或其他不良症状。如果出现不适，立即就医。
引起消化不良，出现腹胀、腹泻等不适。
豆浆里面含有大量的蛋白质和卵磷脂，可以有效的为女性的新陈代谢提供能量，而且其中含有的维生素b族，可以营养神经。但是豆类中含有一定量的低聚糖，可以引起嗝气、肠鸣、腹胀等症状，而豆类及其制品富含蛋白质，其代谢产物会增加肾脏负担，豆类中的草酸盐可与肾中的钙结合，易形成结石，会加重肾结石的症状。
建议：豆浆喝多之后会抑制糖分的吸收，容易导致低血糖，所以不建议喝的特别多。豆浆也不建议和鸡蛋一起食用，不利于营养吸收。
豆浆可以天天喝，但一次喝豆浆过多容易引起蛋白质消化不良，出现腹胀，腹泻不适症状。豆浆中含有丰富的营养物质，如蛋白质、大豆皂苷等，这些营养物质被人体吸收后可以养脑健脑。