头天晚上跑步后第二天双膝关节不适有疼痛感可能是膝关节的滑膜炎，半月板损伤，或者骨关节炎等导致。可以骨科找专业人员当面看看，然后就是膝关节的地方可以做一个X片，必要时磁共振检查。如果是骨关节炎的问题，可以口服药物治疗。
跑步和散步都会对膝关节造成损伤，因为膝关节会受到过度的挤压和摩擦，导致膝关节内部的软骨半月板水肿，引起膝关节周围的韧带、关节囊反复的牵拉痉挛，久而久之就会引起膝关节部位的退变。
导致膝关节周围骨质增生，软骨、半月板出现毛糙甚至断裂，韧带关节囊劳损疼痛。所以跑步和散步都会对膝关节造成损伤，所以在跑步或者散步之前一定要热身，跑步、散步后要按摩膝关节，避免膝关节出现损伤和过早退变。
跑步后膝关节疼痛可能是未热身、膝关节损伤等原因导致的，具体分析如下：
1.未热身：跑步后膝关节疼痛可能是未热身导致的，跑步运动锻炼前让关节适应性活动，包括髋关节，就是下肢热身让肌肉处于亚兴奋状态，然后再去跑步。
2.膝关节损伤：跑步后膝关节疼痛可能是膝关节损伤导致的，可能是因为长期运动性锻炼造成的膝关节的慢性运动性损伤，建议患者通过休息、局部热敷等方式缓解症状。
跑步时减少膝关节损伤需要做好热身运动，选择合适的运动方式。
跑步时膝关节部位受力相对比较大，所以很容易导致膝关节部位出现损伤。若要减少跑中膝关节损伤，跑前应该有一个热身，让膝关节部位有足够的力。再就是跑步过程中，要注意膝关节处保暖，避免膝关节周围韧带、关节囊遇冷之后，造成痉挛而使伤害加剧。再就是在跑步过程中必须选择道路较平的地方，避免道路崎岖，造成膝关节受力不均，造成膝关节内软骨和半月板损伤。再就是在跑步的时候一定要多穿些厚底软鞋、运动鞋，避免造成膝关节部位受力加大，造成伤害。
通常情况下，膝关节半月板损伤患者能跑步锻炼。具体情况分析如下：
半月板损伤的严重程度与跑步是否能进行锻炼有很大的关系，如果损伤比较轻，或者不会造成严重的症状，一般不需要特别的治疗，日常生活中可以进行一些体育锻炼，如慢跑、游泳、爬山等。如果膝关节半月板损伤比较严重，症状特别严重，影响生活，如果患者想要跑步，至少要等完全恢复后，才能进行。
膝关节损伤的类型很多，包括半月板损伤、韧带损伤、前交叉韧带断裂等。轻度的创伤，对关节的运动并不会有太大的影响，是可以跑步的，而重度创伤，病人则不能继续跑步。
骨折完全愈合后，可以进行日常的跑步等运动，如果是前后交叉韧带断裂，需要做前后交叉韧带重建术，术后禁止跑步等剧烈的运动，主要是步行，膝盖半月板撕裂，需要手术，半月板本身的血供不足，修复速度慢，一旦损伤恢复的慢，在跑步中很可能导致半月板的磨损。