跑步时膝盖内侧疼痛可能是，膝盖内侧的鹅足出现了炎症，鹅足是有几个肌腱共同汇聚在膝关节的内侧而构成的组织，当出现炎症或者慢性劳损时就会出现运动时的疼痛。或者是内侧副韧带止点的疼痛，内侧副韧带是稳定膝关节内侧的重要的结构，防止膝关节的外翻，长期跑步膝盖内侧的疼痛可能是由它的损伤造成的。还有可能半月板的损伤，当半月板的体部或者前角出现了撕裂，这时就会出现跑步时膝盖内侧的疼痛。
跑步后膝盖内侧疼可能是骨性关节炎、半月板损伤、鹅足炎等导致的。
1、膝关节退行性病变后，会逐渐出现软骨的磨损、剥脱，从而导致骨性关节炎，关节间隙不平整，多数病人的临床表现为膝关节内侧疼痛，特别是在跑步后会加剧。2、跑步后膝关节内侧半月板损伤，膝关节疼痛、活动受限，活动时疼痛加剧。3、跑步后劳累过度，可能会导致患有鹅足炎。
跑步完膝盖内侧疼可能是受伤造成的，主要是右膝盖的骨骼韧带受伤，导致了右膝盖特别疼痛，要及时停止运动，多进行休息，如果严重，要及时到医院进行检查和治疗，不可剧烈运动。
跑步后右侧膝盖内侧疼是膝关节内侧半月板损伤、右膝鹅足滑囊炎、右胫骨平台内侧髁骨水肿等原因导致的，具体分析如下：
1.膝关节内侧半月板损伤：内侧半月板位于膝关节内侧，股骨内髁与胫骨内侧平台之间，起到缓冲和稳定膝关节的作用。
2.右膝鹅足滑囊炎：鹅足下的滑囊部位，因慢性劳损后产生疼痛。
3.右胫骨平台内侧髁骨水肿:常见于一些比较胖的年轻患者，短时间内长距离的跑步，导致股骨内髁骨水肿，从而出现疼痛。
患者出现膝盖内侧疼痛的情况，建议前往医院的骨科进行就诊，明确病因后对症治疗。
因为引发膝关节内侧疼痛的原因，可能是因为外伤以后导致周围软组织肿胀、渗出，会引起疼痛。或者是生活中活动量增大，导致膝关节周围肌腱韧带长期处于紧张状态，引起的疼痛现像。也可能是关节退变引起了骨性关节炎所导致的。医生会进行膝关节部位的磁共振检查，主要是看什么原因引起的膝盖内侧疼痛，根据具体病因进行对应治疗。
在膝盖疼痛期间，多注意膝盖保暖，避免受凉，避免过度受力的活动，以免导致疼痛症状的加重，或者在医生的指导下，可以临时使用非甾体抗炎药如布洛芬缓释胶囊、美洛昔康片，来缓解膝盖内侧疼痛的症状。