肛周脓肿初期症状主要是哭闹，接触肛门或排便时哭闹加重。随着脓肿形成，可以见到肛周红色肿块，起初肿块质硬，逐渐肿块中间变软破溃溢脓，形成肛瘘，这时患儿哭闹减少，破溃口会反复溢脓。婴儿肛周脓肿大多发生于腹泻患儿，形成脓肿时间较短，2-3天可以见到肿块。婴儿肛门护理十分重要，排便后及时清洁肛门，吸水性能好的湿巾湿布蘸净水分，不要反复擦拭，擦拭肛门不当，容易引起损伤。
肛周脓肿病发时主要是疼痛，最初的疼痛，化脓时跳痛，排便时疼痛加重，脓肿，在肛门前方可发生尿潴留，脓肿肛门后方出现在尾部疼痛。需要及时选择专业的医院进行检查，并根据检查结果进行科学的针对性治疗。
肛周脓肿多由肛腺感染引起，属于肛周急性化脓性感染疾病。任何炎症疾病的特点就是红、肿、热、痛和局部症状。肛周脓肿会出现肛周局部红肿症状，伴有强烈的疼痛感觉，而且疼痛呈持续性。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。