高位单纯肛瘘手术后要2个月才能恢复。要保持大便通畅，养成定时排便习惯。保持肛周清洁卫生，勤沐浴、勤换内裤，每日睡前或便后温水坐浴。适当参加体育锻炼，如散步、打太极拳等，避免久坐、久站。
一般高位性肛瘘手术之后，由于伤口比较大，还有可能合并感染的情况。可以出现伤口不好恢复好，不好愈合的情况。如果有感染，需要控制好感染。到医院复查看看如果有感染的情况，需要清理好伤口。如果脓肿只是切开，没有做肛瘘治疗。也可以引起经常流脓的情况，那就需要到肛肠科做肛瘘治疗术的。
一般高位复杂性肛瘘30-40天才能长好，后期应该勤复查，伤口从基地部涨起，上面的线头应该是长到肉里了，及时到专业肛肠科出理。饮食以清淡为主。勿饮辛辣刺激食物，多休息。
住院时间至少在13~30天左右。完全恢复则需要30天-60天这样，更具体的则根据个人情况不同而有所不同。难的是术后护理，因为肛门功能特殊，容易引发感染，一旦感染了就会延缓伤口恢复、加重疼痛，人会特别痛苦。手术后的肛门护理是肛肠疾病康复的基础。
术后一周到两周能够恢复，而复杂性的肛瘘，蹄铁型的肛瘘，高位肛瘘的病人需要分次手术或者是选择挂线疗法，手术以后每两天到三天收紧挂线一次，这种恢复的时间就比较长，大概两周到三周，术后也要积极的进行静脉抗感染治疗，坚持每天进行换药。
术后一周到两周能够恢复，而复杂性的肛瘘，蹄铁型的肛瘘，高位肛瘘的病人需要分次手术或者是选择挂线疗法，手术以后每两天到三天收紧挂线一次，这种恢复的时间就比较长，大概两周到三周，术后也要积极的进行静脉抗感染治疗，坚持每天进行换药。