总属虚实夹杂，本虚标实。因此辨证首当明辨虚实，标本之主次。初期表现为脓肿症状，又以全身症状为主，即标实为主，当辨热的偏盛，后期则重在局部，特别是复杂性及结核性肛瘘，因病久者多以正虚为主。须辨阳虚阴虚之各异。
肛瘘和痔疮是完全两种性质的疾病。痔疮是血管性的疾病。痔疮是肛门毛细血管扩张形成痔核，在便秘时容易因摩擦出血。而肛瘘是一种感染性的疾病，主要是大肠杆菌引起的软组织的感染，痔疮的症状主要是便血，疼痛，质地偏软。肛瘘主要症状是流脓，疼痛，质地偏硬。
肛瘘的症状是反复脓性分泌物的排出，瘘管通畅无炎症常不感到疼痛，只感觉局部发胀不适，行走时加重，如外口封闭，瘘管积脓，则有疼痛，排便时加重。肛门周围皮肤受分泌物刺激常感觉瘙痒。
肛瘘的症状是反复脓性分泌物的排出，瘘管通畅无炎症常不感到疼痛，只感觉局部发胀不适，行走时加重，如外口封闭，瘘管积脓，则有疼痛，排便时加重。肛门周围皮肤受分泌物刺激常感觉瘙痒。
肛瘘的症状是反复脓性分泌物的排出，瘘管通畅无炎症常不感到疼痛，只感觉局部发胀不适，行走时加重，如外口封闭，瘘管积脓，则有疼痛，排便时加重。肛门周围皮肤受分泌物刺激常感觉瘙痒。