高位肛瘘术后恢复到正常状态的时间长短主要与肛瘘的程度及采取的手术方式有关。另外，也与病人原有体质，并发其他疾病、手术损伤、切囗愈合、术后的治疗和处置、营养等情况密切相关。出院后什么时候可以恢复工作，基本上要等伤口愈合后才可以去正常上班，一般如果伤口不严重，恢复情况良好，出院后至少两个月才可以正常上班。
肛裂手术后注意调养，12天内掉线。40天伤口才可以好。注意平时要坐浴，注意肛周卫生，避免伤口感染。如果症状比较严重，可能时间会长一点，术后要注意保持肛门清洁，饮食要清淡。
高位肛瘘手术术后，一般一个半月能好，关键要注意复杂性肛瘘的内口是否被处理准确，否则就有较多的分泌物。当地医院肛肠科就诊，药物和手术只是一方面，更重要的是从现在开始就做好肛门的护理，具体说就是便后水洗，坐要悬空透气，养成定期温水熏蒸坐浴的习惯，只有这样，再加上注意饮食，不要便秘，不要辛辣，才会减少恶化，加速术后康复。
住院时间至少在13~30天左右。完全恢复则需要30天-60天这样，更具体的则根据个人情况不同而有所不同。难的是术后护理，因为肛门功能特殊，容易引发感染，一旦感染了就会延缓伤口恢复、加重疼痛，人会特别痛苦。手术后的肛门护理是肛肠疾病康复的基础。
高位肛瘘病人需做挂线手术以及类似外科手术，通常手术后要休养一个月才能得到有效恢复，但如果是肛瘘引起的脓肿症状比较严重，就可能要三个月，甚至更长时间才能完全恢复。而在恢复期间，病人必须注意预防便秘，做好伤口部位的护理工作。
如果完全恢复，时间大约在3个月左右，而且刚做完手术的一周内是最痛苦。因为肛门部位的肌肉非常娇嫩，在长合过程中也是非常缓慢，有时因为食物刺激还能发生感染，所以治疗后的护理也显得的特别重要了。术后一周内以流食为主，食物保持清淡，不要饮食辛辣，这样对于伤口恢复非常有帮助。