肛乳头瘤治疗方法是保守治疗，勤观察，灌肠效果很好。可以温水或药物坐浴，局部热敷可以改善血液循环，促进炎症吸收。平时注意肛门卫生，便后及时清洗。吃东西要吃清淡无刺激的，多喝温水，不能喝酒。
手术治疗，可以采取微创手术，可以做肠镜手术，一般手术中需要用麻醉，因此在手术中是感觉不到疼痛的。因为在做肠镜检查时一般不需要麻醉，所以会有明显的感觉，做手术不一样，会采取麻醉，不会有疼痛感的。
肛乳头瘤是肛乳头经常性的被大便摩擦及慢性的炎症刺激等诱因引起的，这个如果症状不是很明显的话，也可以暂时不用进行手术，可以每天进行温水坐浴，平时饮食上主要还是不要吃辛辣的食物，防止便秘。如果症状明显，或保守无效的话，还是需要考虑手术的。
肛乳头瘤与生活饮食习惯和便秘有关，如果症状较重，保守治疗无效，就应该尽早手术治疗。可以选择去正规公立医院进行手术治疗，术后要保持生活规律，清淡饮食，避免烟酒刺激。
肛乳头瘤，一般建议手术治疗，可以采取微创手术，可以做肠镜手术，一般手术中需要用麻醉，因此在手术中是感觉不到疼痛的。因为在做肠镜检查时一般不需要麻醉，所以会有明显的感觉，做手术不一样，会采取麻醉，不会有疼痛感的。
早期肛乳头瘤可用冷冻术，冷冻法多用于痔病的治疗，用于肛乳头瘤的治疗报道不多，当瘤体较小时比较适合。总体感觉复发率高些，且需要冷冻设备，没有切除法简便，也没有切除法易于开展使用。