有些小孩子如果肛门周围出现厌氧菌感染，或者是结核杆菌都可能会引起出现了肛门周围脓肿发炎的产生，也可能会导致局部疼痛的症状。孩子如果出现了肛门脓肿的现象，可能是由于直肠部位的化学注射药品刺激导致的这一现象，有的如果出现了腹膜穿孔感染，会引起肛门周围出现脓肿的产生，还可能会引起局部麻醉和疼痛的感觉。
肛周脓肿的主要病因为肠道菌群失调和机体免疫力下降。该病的病原体为肠道内细菌，致病菌经肛窦侵入，于肛腺内引起感染，发生扩散，此为感染途径，最后的发病部位为肛周间隙，即形成肛周脓肿。
得肛周脓肿是因为肛裂、大便干燥或用力排便等引起肛管直肠内微小损伤，肠道内细菌可经过损伤处的肛腺浸入到肛管直肠周围间隙而形成感染，进而形成脓肿。如果脓肿的位置较深，则可能有发热、乏力等全身症状。
肛周皮下脓肿主要是疼痛，最初为胀痛、化脓时跳痛、排便时疼痛加重，脓肿在肛门前方可发生尿潴留，脓肿在肛门后方出现尾骶部疼痛。全身中毒症状轻，局部肿胀，发红、压痛、有波动感。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，病人不能端坐。
婴儿肛周脓肿有两种观点。其中一个与肛周皮肤如尿布的磨损有关。婴儿的皮肤很脆弱，容易腹泻和便秘。如果肛门周围的皮肤被尿布或硬大便擦伤，或细菌在腹泻时进入肛门，很容易引起肛门周围感染和肛门周围脓肿。
肛周脓肿是感染引起的。肛门是人体排泄物的一个出口，所以肛周围炎症可以导致肛周围腺体的堵塞，细菌污染后，长久不愈合便可以引起感染，也就得了肛周脓肿。还有一些外痔、内痔的炎症疾病不能及时处理，加上粪便的污染，进而可以感染肛门周围继发脓肿。