一般情况下，引起慢性直肠炎的病因有很多，应在辩证的基础上，明确病因，根据病因，对症治疗。
口服药物有时候是中成药，有时候是中草药熬制成汤剂，中成药用的比较多的是肠炎宁，归脾丸，补充益气丸等。中草药一般是具有清热解毒，消肿散结，消炎止疼的功效，临床上比如黄连，黄芪，党参，蒲公英，五倍子等。也可以用以上中药煎汤灌肠治疗。取足三里、上巨虚、天枢穴、合谷穴等穴位。
直肠炎是可以使用中药调理一段时间的，但由于发病的原因不同，所以使用的药物也是不同的，所以一定要遵医嘱吃药，而是一定要有一个良好的心态，不要吃一些不好消化的食物，吃东西的时候一定要细嚼慢咽。
直肠炎反复患者可以口服氧氟沙星、甲硝唑、奥硝唑等药物治疗。
直肠炎患者除了要积极配合医生治疗以外，平时要养成良好的饮食习惯，注意饮食卫生，戒烟戒酒，避免浓茶浓咖啡，不能吃辛辣刺激性食物，注意腹部保暖。治疗期间患者要注意多休息，同时坚持清淡饮食，不要吃辛辣刺激性食物，比如火锅、冰可乐等，有利于身体恢复。
直肠炎回出现拉肚子，腹痛可以用中药进行调理的，但由于发病的原因不同，所以使用的药物也是不同的，平时应注意少食辛辣生冷刺激性食物，海鲜也应少吃，多吃些蔬菜和水果。
目前也可以使用健脾胃的药物，具体用药请遵医嘱，同时也可以自己按摩一下足三里或者中脘穴，可以进行针灸或者艾灸调理。直肠炎中医方面主要考虑是一些脾胃虚弱为主，可能是因为长时间吃一些辛辣刺激性的食物导致的，容易出现一些腹痛腹泻的症状。