肛瘘的治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。肛瘘不能自愈，不治疗会反复发作，需要手术治疗。肛瘘的手术方式很多，手术是减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁，同时避免肛瘘的复发。
肛周囊肿是因为肠道细菌进入肛窦，引起肛腺感染，蔓延至肛周间隙。多食果蔬，多吃富含膳食纤维的食物饮食上应以清淡并含较多纤维素的食物为宜，食用有清热解毒的食品，能缓解肛门局部肿痛、渗出等症状。
肛周脓肿是由于肛管直肠周围软组织或周围间隙内发生急性化脓性感染所致。建议出现肛管直肠周围脓肿应及时治疗，少数肛周表浅的脓肿可采用抗生素治疗、热水坐浴、局部理疗等方法消散，但多数需要手术切开脓肿，充分引流脓液，防止其不断扩散，以减轻疼痛等症状。
肛周囊肿治疗：首先需要注意饮食的调理，清淡容易消化的食物，多吃水果蔬菜，保持大便的通畅，便秘可以加重症状的，一般是不会自己痊愈的，如果不及时处理，浓腔破溃后就发展形成肛瘘，肛瘘治疗就相对复杂了，所以建议在医生的指导下消炎治疗，如果浓液太多没法控制，要尽快切开引流。及早就医，行正规治疗。
越早手术越好，因为这与医生的技术和经验有很大关系，所以建议一定要到正规的肛肠专科医院手术治疗，建议注意饮食规律，不过饱过饥，不食用生冷寒凉的食物，生活中可以多增加姜枣，扁豆等具有健脾功效的食物。