因为大便干结容易擦伤肛窦，再加上细菌侵入而感染，腹泻者多半有直肠炎和肛窦炎的存在，可使炎症进一步发展。大便干燥硬结，在排便时易擦伤肛隐窝引起肛周感染，腹泻日久，也可刺激肛隐窝发炎，稀便也易进入肛隐窝，诱发肛周感染，因此防治便秘和腹泻对预防肛周脓肿和肛瘘形成有重要意义。
患了肛瘘要注意保持大便通畅柔软，养成定时大便习惯，有便意时要尽快上厕所。每天多吃水果蔬菜，可多吃香蕉、红薯、蜂蜜。要戒酒和避免吃辛辣食物，这样病情会有所好转的。
肛瘘的病人应注意肛门部清洁卫生极为重要，应经常用温水泡洗肛门，最少每晚要洗一次。一则可保持局部清洁。二则可改善肛门部血液循环，增强抵抗力，减轻炎症反应。一般可用温盐水进行相关的肛痿的护理。肛痿发炎化脓时，如外口闭塞，可用消毒的针头挑破外口，排出脓液，既可减轻胀痛，又可预防脓液向其他部位蔓延。同时可用清热解毒的中药煎汤外洗。
肛瘘肛裂的手术之后一定要多喝水，多吃一些新鲜的蔬菜和水果养成定时排便的习惯，注意保持大便的通畅，避免大便干燥的情况。另外就是一定要按时进行换药，注意保持创面的引流通畅。
肛瘘手术后要避免生冷、辛辣等刺激性大的饮食，还要注意避免不容易消化的食物，更要注意避免饮酒。病人应该以容易消化的食物为主，多吃鱼、肉、蛋等营养价值高的物质，才能利于术后创面的愈合。