肛门囊肿主要因为肛腺感染而发病，也可以继发在肛周皮肤感染、内痔、损伤等，肛门部位发病后，会产生疼痛的症状，疼痛非常的严重，且会产生跳痛的症状。痔疮容易发生在任何的年龄，是一种常见的肛肠疾病，单纯性的内痔，没有疼痛出现，但会产生明显的坠胀感，导致出血加重，且会发展成为脱垂。
痔疮是肛垫病理性肥大、移位及肛周皮下血管丛血流淤滞形成的团块，并因此而引起出血、栓塞或痔核脱出，可分内痔、外痔、混合痔等。肛门囊肿是指肛门直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性或慢性化脓性感染，并形成脓肿。
肛门囊肿是一种错误的说法，其实是指肛周脓肿。肛周脓肿是肛周感染化脓性的一种疾病，都是肛腺感染引起，表现为肛门周围的红、肿、热、痛和局部症状。痔疮基本都是肛垫下移和静脉曲张引起，包括内痔和外痔。痔疮治疗原则和肛周脓肿不同。
肛周脓肿属于细菌感染，主要是表现为肛门周围的肿物，有红肿热疼的表现，脓肿触摸有波动感，疼痛明显，而痔疮是各种原因导致的，肛门处的浅表静脉丛的静脉曲张而形成，分为内痔，外痔和混合痔，表现主要是有出血，疼痛，水肿脱出，瘙痒等。
痔疮大便时会出血，特点是无痛，血色鲜红；平时也会疼痛，常与排便不尽感觉同时存在；有的会痛痒肛门周围痛痒，甚至皮肤湿疹，常使病人极为难受。囊肿基本没有明显的临床症状，只有感染扩散形成肛门脓肿以后，才产生红、肿、热、痛的炎症症状。
可以出现肛门周围出现肿物，诱发加重可以引起肿物增大，疼痛的症状，内痔可以出现出血的症状，肛周脓肿一般肛周有肿物，容易引起红肿疼痛的情况，破溃之后可以引起肛瘘可能是痔疮引起的，属于外痔，如果没有增大，还有疼痛，属于静止期的，平时要注意减少大便干燥，还有少吃辛辣的食物，可以预防痔疮加重的情况。