肛瘘不能自愈，要手术治疗。手术治疗原则是将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围瘢痕组织同时切除，使伤口自基底向上缝合。也可选用挂线疗法、肛瘘切开或切除术。少数可行肛瘘切除后一期缝合或游离植皮。
建议到医院检查一下，肛瘘是比较常见的肛门部位的疾病。肛瘘在明确诊断以后，首选的治疗方案就是手术治疗，因为肛瘘通过保守治疗往往没有任何的效果，达不到治好的目的。同时一定要注意自己的饮食，避免辛辣的食物。
肛瘘非手术不能治好。其传统手术常见的有瘘管切开术、肛瘘切除术和挂线疗法，这些方法虽然可以有效治疗肛瘘，但是手术过程非常疼痛，尤其是术后恢复时间超长，一般需要一个月左右的时间住院观察调养。
肛瘘有很多治疗方法。常用的是药物疗法，手术方法和微创疗法，肛瘘由内外口和瘘管组成，如果肛瘘严重，可能有多个瘘管和瘘管。很容易复发，这是传统手术的一大缺点，肛瘘想要彻底治疗，还需要微创手术肛瘘的治疗方法。
肛瘘的治疗方法目前普遍采取手术治疗，手术是肛瘘的唯一方法，肛瘘分为单纯性和复杂性，低位和高位，手术方式也不一样，如果是高位肛瘘需要采取挂线治疗，一次性切除容易损伤肛管直肠环而引起肛门失禁等。
出现假性愈合需要将伤口打开让重新从里往外踏实的生长，可以进行肛门手术进行治疗，这种治疗方法比较安全有效。肛瘘术后的伤口愈合是肛瘘手术成功的关键。肛瘘术后一定要坚持换药，大便后和换药前一定要用洗液对伤口进行彻底清洗，有分泌物属于正常，将分泌物擦拭干净。要过度活动或者摩擦伤口，以免肉芽生长过高导致假性愈合。