如果只是比较表浅的脓肿，可以以消炎治疗为主，同时，可以配合局部外用消炎药促进炎症消退。如果已经形成明显的脓肿且疼痛剧烈，可能就需要前往医院手术治疗，行脓肿切开引流。
肛周出现囊肿，如果囊肿不是很大，没有异常的不适症状，可以暂时观察情况。但要注意保持卫生，注意清洁防止复发。如果很严重会出现感染流脓，肛门疼痛，就需要手术治疗，否则会影响病人的正常生活的。
表浅脓肿可选择口服光谱抗生素，对范围相对大的脓肿需联合用药。早期通过积极的手术治疗，绝大部分肛管直肠周围脓肿可获得理想的效果。高位脓肿病情复杂，存在反复发作可能。极少数因感染过重，可造成死亡。
得了肛周囊肿要去相关机构进行检查治疗。可以多吃新鲜蔬菜水果补充营养，也可以通过一些食补，比如鸽子汤、黑鱼汤等补充元气。但是在饮食上是需要忌口的，就是辛辣刺激食物不能吃，还要戒烟戒酒。
肛周囊肿最多见的就是皮脂腺囊肿，或者是浅表的感染之后继发的囊肿，会有明显的肿物，或者病人出现排便异常，甚至排便不成形，排便困难；反复的刺激也会导致大便带血，进而影响到病人的生活或者工作。