常见的原因是肛周脂肪组织比较多，比较松软，肠道细菌通过肛窦进入到肛周间隙而形成感染。有时外阴部护理不当，也可能会造成肛周囊肿。如果是轻度的肛周脓肿，局部表现为发红，可能摸着会有硬块。
肛周脓肿是由于肛窦炎造成的，多为肛腺隐窝处，肛窦感染所致，临床上常见的包括，腹泻，上火，免疫力低下等。肛周脓肿的治疗，如果处理的不是那么彻底，就会反复的发作，也有可能会导致其他的症状的发生。所以要重视肛周脓肿，选择有效治疗肛周脓肿的方法。
出现肛周囊肿主要与各种因素引起肛腺感染有关，比如痔疮、肛瘘、肛门周围皮肤毛囊汗腺炎及肛门周围皮肤病等感染。除此之外，与医源性因素、术后因素等引起肛周皮肤损伤感染所致。
如果已经形成脓肿了应该及时切开引流及换药治疗，继而疼痛加剧、红肿发热、坠胀不适、坐卧不宁、夜不能眠、大便秘结、排尿不畅成里急后重等直肠刺激症状，有肛周脓肿要积极抗感染治疗，给以手术引流脓肿，保证大便通畅，注意个人卫生。
肛周囊肿是由于肛周有很多腺体，会分泌一些东西，如果能较通常的排出体外，就没有问题，如果局部排泄不畅，就会诱发脓肿。肛门囊肿一般也因久坐的情况引起的血液循环不好，便秘，经常吃辛辣刺激的东西引起的炎症反复刺激造成的。