肛瘘的发生往往与湿热有密切关系，所以油腻生湿热的食物应有所节制，同时要戒除烟酒及嗜茶的习惯。应多食清淡并含有丰富维生素的食物，如冬瓜、丝瓜、绿豆、萝卜等。经久不愈的肛瘘多属虚型，饮食上应食含有丰富蛋白质类等食品。
手术以后的饮食就非常重要，首先要进食容易消化的食物，多吃水果和蔬菜，尽量保持排稀便，纠正便秘，适当的进行功能锻炼。并且要避免暴饮暴食，每次在排便之后要及时的进行清洗，并且找医生进行换药。
长期不治疗会导致癌变。肛瘘初期的时候产生的危害并不大。但是时间一旦加长，将会产生很大的伤害，肛瘘如果长期不采取治疗措施就会危害到身体，甚至还有可能导致癌变的可能性。
肛瘘病人不宜吃口味过重的食物，切忌辛辣，生冷，口味宜清淡，如多喝米粥等有利于肠道蠕动的食物。辛辣的食物，易使病人上火。饮酒对肛瘘病人的术后恢复起到阻碍作用，过量饮酒可能会使伤口复发，因此，肛瘘病人不可以饮酒。
肛瘘是肛腺感染化脓引起的，绝大部分都需要手术治疗，不能自愈。因为脓肿虽然破溃或已切开引流，但原发感染源如肛窦炎、或肛腺感染依然存在，肠腔内容物还可从内口继续进入瘘管;肛瘘的治疗可以采用瘘管切开术，肛瘘切除术，或者可以用中医的挂线疗法。