直肠炎的治疗主要是三个方面，调整饮食生活，少渣饮食为主，荤素搭配。避免劳累熬夜吸烟酗酒。药物治疗主要是促进黏膜修复，缓解炎症改变，调理肠道紊乱为主。中医中药治疗目前较为常用的穴位埋线治疗。直肠炎一定要坚持治疗避免其迁延不愈引发结肠炎或是直肠溃疡等疾病影响生活质量。
避免受凉。要饮食有规律，一日三餐做到定时定量，不过分饥饿、不暴饮暴食，这样有利于肠道消化平衡，避免因无节制饮食而致肠道功能紊乱。病人适当休息，进清淡、少渣、营养丰富、无刺激性的食物，并做到心情愉快，劳逸结合。
直肠作为大便必经的最后通道，长期的炎症刺激，以及致病菌、大便中的致癌物等各方面的刺激，都可引起直肠炎转化为癌症的可能，从而诱发直肠癌。患了感染性直肠炎是可考虑保守治疗的。
很多时候直肠炎与人们不良饮食习惯造成的。直肠炎病人应忌食易产酸食物，如地瓜、土豆、过甜点心及糖醋食品等。禁食产气食物，如生葱、生蒜、生萝卜、蒜油、洋葱等。禁食生冷食物。
可以服用一些补脾益胃的中成药进行调理，结合自己按摩一些穴位来调理，建议选取足三里，天枢，内关等穴位，每天按摩半小时，以局部酸胀感为度，坚持一段时间，效果也不错。