肛窦炎也可以部分用一些痔疮软膏来治疗，起到一定的作用。当然，药物治疗前可以使用蒲公英坐浴进行辅助治疗，更多的是需要注意饮食，辛辣刺激的食物是不能吃的，多喝水，多吃新鲜蔬菜、水果和粗纤维食物，并有规律地生活，只有这样才能定期避免便秘。
患有肛窦炎的病人可以用温盐水坐浴治疗，然后在肛窦底部使用5~银酸溶液，也可以用少量橄榄油灌肠。也可以使用各种类型软膏剂，同时口服抗生素。急需手术。肛窦炎如果不及时治疗，很容易引起肛瘘。
治疗肛瘘炎最佳方法是手术治疗，术后配合药物和一般治疗。手术治疗的具体方法有挂线疗法、瘘切开术、主灶切开对口引流法、瘘切除术、瘘切除术一期缝合术等治疗方法，具体选择是根据肛瘘内口位置、瘘的走向、瘘的深度等，综合评定后选择手术方式。
肛窦炎可以用一些消炎抗菌的药物治疗。如果药物治疗效果不好，也可以通过手术治疗。肛窦炎是指肛门直肠区域发生的炎症。性病变可能导致肛门周围发红、肿胀和瘙痒等症状。必要时，应该去医院检查并听从医嘱。在平时生活当中，应小心清洁下体。
出现了肛窦炎如果是比较轻点的就可以选择药物，主要抗生素类药物消除炎症药物，如果是较严重的肛窦炎就要选择手术治疗了。肛窦由于其特殊的解剖结构容易出现炎症问题，基本上细菌的比较多，严重的可导致肛周脓肿的出现。