肛周脓肿可以药物治疗：可以口服抗生素、使用外用药物或者内用药物进行治疗，主要起辅助作用。肛周肿囊主要是由于细菌感染引起的，所以病人要有良好的卫生习惯，勤洗换内裤，保持肛门的干燥和清洁，同时也要进行适当的身体锻炼，增强自身的体抗力，增加肛门部的抗病能力。
一般情况下，肛周脓肿患者初期，可出现肛门不舒服、胀痛或疼痛等症状，特别是排便后，患者还可出现烦躁、还不规则低热等症状，这是因为肛周脓肿多由肛腺反复感染引起，常见于免疫力低下或患有糖尿病的人。正常情况下，肛周脓肿都比较容易治愈，但如果治疗不彻底的话就可能出现复发问题。因此，建议肛周脓肿的患者应及时就诊，在医生指导下进行治疗。以免影响身体健康。
肛周脓肿较难，该病为肛周特殊部位感染，即肛门部肛腺感染，沿皮肤和黏膜间隙潜行扩散，故有别于体表疖、痈感染。因皮肤和黏膜比较牢固，不易突破，故局部或全身用药很难控制，微小肛周感染，可通过局部坐浴，口服消炎药。
肛周脓肿去正规医院比较好。肛周脓肿是肛门周围软组织间隙的化脓性感染，处理不当容易形成肛瘘。对于肛周脓肿，早期可以采取温水坐浴，使用抗生素控制感染，如果已经有脓液形成，就应该尽早到正规医院切开引流处理。要清淡饮食，多吃蔬菜和水果，多喝水，避免油腻辛辣刺激性食物，注意休息，避免烟酒刺激，不要挤压肿块。
抽脓减压局部消毒，可暂时减轻脓腔张力，缓解疼痛，适用于临时应急处理，但不能代替手术。切开排脓属于暂时性应急处理。可排出脓液，迅速减轻症状，但不能代替治疗术，一般约需3个月左右，待瘘管形成，内口明确，再行治疗术。为进一步减少手术创伤，可采取双向等压引流手术治疗，术中采取半切割挂线，并放置引流管，可不切断肛直环而使脓腔愈合。
肛周脓肿的病人早期会表现为肛门不适，发胀或者有疼痛的表现，尤其是在排便以后，病人也会表现为坐立不安，也会有不规则的低热，因为肛周脓肿的发生原因，主要是由于肛腺的反复感染所导致的，也可以见于免疫力低下或者有糖尿病患者。