肛周脓肿有保守治疗和手术治疗两种治疗方法，两种治疗效果完全不同。手术治疗是更好的一种治疗方法，可以一次性的将肛周脓肿治好。保守治疗只是对肛周脓肿进行控制，或起到减轻的作用。
如果确认肛周脓肿，那么需要切开引流。手术切开引流后需要外科换药，同时需要静滴抗生素治疗。治疗期间，不要吃辛辣食品，不要吃寒凉的食品，清淡饮食，均衡饮食即可。要生活规律，清淡饮食，多喝水，注意休息，不要挤压肿块。
婴儿肛周脓肿需要手术治疗，可以尽快带宝宝到儿科就诊。小儿出现肛周脓肿，与成年人的治疗方法一样，需要手术切开引流。建议带孩子去医院外科手术切开引流，经常进行刀口换药会慢慢得好起来的。
脓腔与肛瘘相通的脓肿：可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确。
肛周脓肿的治疗方法是采用综合的治疗手段，包括抗菌素治疗、温水坐浴、局部理疗，口服点药来减轻排便时的疼痛。另外，最主要的治疗方法是手术治疗，也就是进行脓肿切开引流手术。手术方式要根据脓肿的部位不同来选择不一样的手术方式。肛周脓肿切开引流手术后，绝大部分病人会形成继发性的肛瘘，所以有的医生会采用脓肿切开引流加切开挂线手术来避免肛瘘的形成。
肛周脓肿治疗时间是发病三天之内，三天过后保守治疗的效果会大打折扣，五天之后就需要进行手术治疗了，肛周脓肿临床症状表现是以红，肿，痛等主，如果一旦出现了这些症状的时候，朋友们应该立刻去正规的肛肠科进行检查，一旦确诊要积极配合进行治疗。