肛瘘的治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。肛瘘不能自愈，不治疗会反复发作，需要手术治疗。肛瘘的手术方式很多，手术是减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁，同时避免肛瘘的复发。
肛周脓肿是由于肛管直肠周围软组织或周围间隙内发生急性化脓性感染所致。建议出现肛管直肠周围脓肿应及时治疗，少数肛周表浅的脓肿可采用抗生素治疗、热水坐浴、局部理疗等方法消散，但多数需要手术切开脓肿，充分引流脓液，防止其不断扩散，以减轻疼痛等症状。
肛周囊肿会有自行破溃的可能，如果确诊是肛周囊肿，但是自己破了并不是好了，还需要自行消毒处理消炎，或者通过手术以免扩散。平时避免进食辛辣刺激食物和饮酒，每天可以给予温水坐浴。
得了肛周囊肿要去相关机构进行检查治疗。可以多吃新鲜蔬菜水果补充营养，也可以通过一些食补，比如鸽子汤、黑鱼汤等补充元气。但是在饮食上是需要忌口的，就是辛辣刺激食物不能吃，还要戒烟戒酒。
肛周囊肿如果不积极治疗，破溃后会形成肛瘘，大便会从瘘道流出。炎症也会慢慢扩散，引起严重的并发症。平时可以经常参加多种体育活动如广播体操、太极拳、气功、踢毽子等。